Sub-Saharan SeqNet

Kontext

Erkrankungen der Lunge sind weltweit zunehmende Ursachen für Krankheitslast und Sterblichkeit. Jedes Jahr werden etwa 10 Millionen neue Fälle von Tuberkulose (TB) und rund 1,5 Millionen daraus resultierende Todesfälle erfasst. (Multi-) resistente Stämme erschweren zusätzlich die globale TB-Bekämpfung und gefährden das Ziel der WHO, die TB-Epidemie bis 2030 zu beenden. Darüber hinaus hat die COVID-19-Pandemie Millionen von Todesfällen verursacht und zu einem noch nie dagewesenen Ausmaß an Fällen des Schweren Akuten Respiratorischen Syndroms Typ 2 (SARS-CoV-2) und des Post-COVID-Syndroms geführt. Die Förderung von molekularen Diagnostikmöglichkeiten (einschließlich Genomsequenzierung) und Surveillance sowie die Translation dieser Ansätze in die klinische Praxis und das Gesundheitswesen haben sich als vielversprechend für die Bekämpfung von Lungeninfektionen erwiesen. Next Generation Sequencing (NGS)-Technologien sind eine herausragende Methode zur Verbesserung der Diagnostik und der Integrierten Molekularen Surveillance. Aufbauend auf den Erkenntnissen und Erfahrungen aus früheren Projekten, in denen moderne Sequenzierungstechnologien für eine schnelle TB-Resistenzbestimmung und -überwachung eingeführt wurden, setzt dieses Projekt die Umsetzung und Verankerung der Genomsequenzierung für die Erregerdiagnostik und Surveillance in den Projektländern fort. Vorwiegend im Fokus stehen dabei Nationale Referenzlaboratorien sowie verantwortliche Labore in Eswatini, Mosambik und Namibia, die im Bereich Erregerdiagnostik und -überwachung arbeiten und deren Personal Trainings zur Durchführung von Genomsequenzierungs-Methoden erhalten wird. Zusätzlich werden Mitarbeitende des öffentlichen Gesundheitswesens darin geschult, Infektionsketten zu verfolgen, und Klinikerinnen und Kliniker erlernen die Bestimmung molekularer Resistenzprofile und die Entwicklung und Anwendung von personalisierten Behandlungsstrategien auf der Grundlage internationaler Leitlinien. Dies ermöglicht effizientere Therapiekonzepte und fördert das Wohlbefinden von Patientinnen und Patienten, indem es die Behandlungsdauer verkürzt und die Therapieergebnisse verbessert.

Ziel

Einführung und Etablierung modernster Sequenzierungstechnologien wie dem Next-Generation-Sequencing (NGS) zur Diagnose und Überwachung von resistenten oder multiresistenten Erregern von Lungenerkrankungen (insbesondere Tuberkulose und SARS-CoV-2).

In Zusammenarbeit mit

• Ospedale San Raffaele (OSR), Italien
• Inselspital Bern (ISB), Schweiz
• Ministry of Health (MoH Eswatini), Eswatini
• National TB Reference Laboratory (NTRL Eswatini)
• Eswatini COVID-19 National Laboratory (COVIDLab Eswatini)
• Eswatini National TB Control Programme (NTCP Eswatini)
• Eswatini Baylor College of Medicine (BCM Eswatini)
• Eswatini Baylor College of Medicine Houston (BCM Houston)
• USA Instituto Nacional de Saúde (INS)
• Mosambik University of Namibia School of Medicine (UNAM), Namibia