Stärkung der SARS-CoV-2-Sequenzierungskapazität in Westafrika
Seit mehr als einem Jahr haben unsere GHPP-Partnerlaboratorien in Guinea und Nigeria Kapazitäten für die Sequenzierung von SARS-CoV-2 im Land aufgebaut und mehr als 450 SARS-CoV-2-Sequenzen bei GISAID geteilt. Um ein eigenständiges Management dieser Kapazitäten und die Fachkenntnisse der Teams zu stärken, wurde im Oktober 2022 in Guinea eine gemeinsame Auffrischungsschulung für Guinea und Nigeria durchgeführt.
Mit Unterstützung des GHPP Corona-Global Programms wurden zwei SARS-CoV-2-Sequenzierungslabore unter Verwendung der MinION-Technologien (Oxford Nanopore Technologies) erfolgreich in zwei unserer Partnerlabore in Guinea und Nigeria implementiert. Nach mehreren Schulungen, die 2021 und 2022 im Laboratoire des Fièvres Hemorragiques Virales en Guinée (CRV-LFHVG) in Guinea und im April 2022 am Irrua Specialist Teaching Hospital (ISTH) in Nigeria durchgeführt wurden, führen die Labore unabhängig voneinander die genomische Überwachung von SARS-CoV-2 in ihren jeweiligen Ländern durch. In den vergangenen Monaten haben die beiden Sequenzierlabore zur globalen genomischen COVID-19-Überwachung beigetragen, indem sie mehr als 450 Sequenzen auf der GISAID-Plattform geteilt haben und damit direkt zum weltweiten Monitoring zirkulierender Varianten beigetragen haben.
Um diese erfolgreiche Umsetzung zu stützen, fand im Oktober 2022 am CRV-LFHVG eine gemeinsame Auffrischungsschulung von Guinea und Nigeria zu Sequenzierungsverfahren, einschließlich bioinformatischer Analyse, statt. Ein Team des BNITM und zwei Laborwissenschaftler des ISTH reisten für diese zweiwöchige Auffrischungsschulung zum CRV-LFHVG in Conakry. Auch Mitarbeiter:innen des CRV-LFHVG nahmen an der Schulung teil. Hauptziel war es, das theoretische Wissen und die praktischen Fertigkeiten des lokalen Laborpersonals zu festigen, um die Grundlage für eine künftige Kapazitätenerweiterung auf ein breites Spektrum anderer viraler Erreger zu schaffen. Dies steht im Einklang mit der „Global Genomic Surveillance Strategy“ der Weltgesundheitsorganisation (WHO) und der bevorstehenden neuen Phase des GHPP-Programms.
Diese Maßnahme wurde mit Unterstützung des GHPP in Zusammenarbeit mit der Weltgesundheitsorganisation (WHO) und dem Global Outbreak Alert Response Network (GOARN) im Rahmen des Einsatzes von Expert:innen des European Mobile Laboratory (EMLab) als Reaktion auf SARS-CoV-2 durchgeführt.
Stand: Dezember 2022
