Sequenziertraining für SARS-CoV-2 Genom-Analyse in São Tomé erfolgreich durchgeführt

Im Juli 2021 führte das BNITM-SToP-CoV-Team zusammen mit Partnern vom Laboratório Nacional de Referência da Tuberculose (LNR-TB) in São Tomé ein Training zur Implementierung der Genom-Sequenziertechnologie im nationalen Referenzlabor für COVID-19 durch.

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Die Teilnehmende des Sequenziertrainings mit Kathrin Schuldt und Doris Winter vom BNITM. (Quelle: BNITM)

Im Juli 2021 erhielten 12 Labokräfte eine zweiwöchige theoretische und praktische Einführung in die Nanopore-Sequenzierung. Teilnehmende des Trainings waren Laborpexpert:innen des nationalen Referenzlabors für COVID-19, dem Laboratório Nacional de Referência da Tuberculose (LNR-TB), zugehörig zum Gesundheitsministerium, sowie Laborexperten des nationalen Labors für Tiergesundheit und des Centro de Investigação Agronómica e Tecnológica (CIAT), zugehörig zum Landwirtschaftsministerium.

Das Training bestand aus praktischen und theoretischen Trainingsmodulen. U.a. wurden die Theorie der Vollgenom-Sequenziertechnologie, die Aufbereitung von infektiösen SARS-CoV-2-Proben im Labor, die Analyse der Proben mit Hilfe des MinION-Sequenziergeräts und die anschließende bioinformatische Datenanalyse von Sequenzdaten vermittelt. Zusätzlich wurde die Erstellung von standardisierten Laborprotokollen und nächste Schritte zur Implementierung einer genomischen Surveillance behandelt.

Theoretische Einführung in die Vollgenom-Sequenziertechnologie. (Quelle: BNITM)

Mit erfolgreichem Abschluss des Trainings wurden die Teilnehmenden befähigt, die neue Technologie selbstständig durchzuführen. So können derzeit zirkulierende SARS-CoV-2 Varianten in Sao Tomé sowie neu auftretende Virusvarianten identifiziert und mit den nationalen Behörden sowie der internationalen Forscher:innen-Gemeinschaft geteilt werden. Während des Trainings wurde die Bevölkerung in einer Pressemitteilung des Gesundheitsministeriums direkt über das Vorkommen der durch die Sequenzierung identifizierten und leichter übertragbaren Delta Variante des Virus informiert.

Eine Teilnehmerin appliziert eine Probe auf das Sequenziergerät. (Quelle: BNITM)

Stand: September 2021

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