CLEAR – Corona Global

Brève description

Les infections des voies respiratoires font peser un énorme fardeau sur les systèmes de santé des pays à revenus faibles et intermédiaires. Dans le contexte de la pandémie actuelle, le dépistage précis et rapide des agents pathogènes à l’origine de ces maladies des voies respiratoires est de plus en plus important, notamment en Afrique. Les capacités des services de santé pour prendre en charge les cas graves y sont souvent limitées et le diagnostic basé sur les agents pathogènes est un défi, notamment pour les hôpitaux ruraux. Malgré la vaste zone desservie et le nombre élevé de cas qui y sont traités, ils manquent souvent de ressources pour dépister rapidement les différents agents pathogènes des voies respiratoires susceptibles d’entrer en ligne de compte. Le manque de connaissances complique la prise de décision sur la nécessité d’isoler les malades et la distinction par rapport aux maladies apparentées à la COVID‑19, ce qui entraîne également un usage inadapté d’antibiotiques à large spectre.

De ce fait, ce projet vise à créer des capacités de laboratoire permettant la détection moléculaire rapide d’un large éventail d’agents pathogènes respiratoires, dont le SARS‑CoV‑2, dans un hôpital de district à Assin Foso, dans la région centrale du Ghana. En plus du diagnostic différentiel, ce projet cherche à générer des connaissances sur les facteurs de risque susceptibles de déclencher des formes graves de COVID‑19 et des affections post‑COVID (COVID de longue durée). Les connaissances acquises jusqu’à présent sur la COVID de longue durée proviennent essentiellement du Nord global, alors que cette maladie est peu connue dans les pays à revenus faibles et intermédiaires.

Le projet CLEAR accompagnera des malades chez qui une infection au SARS‑CoV‑2 a été diagnostiquée par un test de réaction en chaîne par polymérase (test PCR) afin d’explorer les facteurs cliniques, sociodémographiques et biologiques ayant un impact sur l’apparition d’une affection post‑COVID‑19.

CLEAR comporte deux piliers :

1. Augmentation des capacités d’analyse moléculaire en laboratoire en vue de la détection des agents pathogènes respiratoires, dont le SARS‑CoV‑2, afin de soutenir les efforts déployés par un hôpital de district de la région centrale du Ghana pour combattre la pandémie :
   • fourniture d’équipements de laboratoire pour le diagnostic moléculaire
   • formation du personnel de laboratoire en matière de diagnostic moléculaire (y compris agents pathogènes viraux et bactériens), méthodes microbiologiques et tests de sensibilité aux antibiotiques
   • intégration au projet Stand-AMR : « Développement d’un prototype de laboratoire pour la surveillance des RAM en Afrique subsaharienne » (projet, financé par le GHPP, déjà en cours)
2. Recherche dans le contexte de la pandémie afin de générer des informations pour la santé publique :
   • sur les diagnostics différentiels, les facteurs de risque et les tableaux cliniques de cas confirmés de COVID‑19 par rapport aux cas de maladies apparentées à la COVID‑19
   • caractérisation et identification de facteurs de risques pour les affections post‑COVID au sein de la population étudiée