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Contexte

Les maladies pulmonaires représentent une cause croissante de morbidité et de mortalité à l’échelle mondiale. Chaque année, près de 10 millions de nouveaux cas de tuberculose (TB), et quelque 1,5 million de décès en résultant sont enregistrés. Des souches (multi)résistantes rendent encore plus difficile la lutte mondiale contre la tuberculose et compromettent l’objectif de l’OMS de mettre un terme à l’épidémie de tuberculose à l’horizon 2030. En outre, la pandémie de COVID 19 a causé des millions de morts et entraîné un nombre jusque-là inégalé de cas de syndromes respiratoires aigus sévères de type 2 (SARS CoV 2) et de syndromes post COVID. L’appui aux possibilités de diagnostic et de surveillance moléculaires (dont le séquençage génomique) et à la transposition de ces approches dans la pratique hospitalière et le secteur de la santé ont fait preuve d’une efficacité prometteuse dans la lutte contre les infections pulmonaires. Les technologies de séquençage de nouvelle génération (SNG) sont une excellente méthode pour améliorer les diagnostics et la surveillance moléculaire intégrée. S’appuyant sur les enseignements et les expériences de projets antérieurs dans lesquels des technologies de séquençage modernes ont été mises en œuvre pour identifier rapidement et surveiller les résistances TB, ce projet poursuit la mise en œuvre et l’ancrage du séquençage génomique dans les pays partenaires en vue du diagnostic et de la surveillance des agents pathogènes. Dans ce contexte, l’accent est mis sur les laboratoires nationaux de référence ainsi que sur les laboratoires responsables en Eswatini, au Mozambique et en Namibie, qui travaillent dans le secteur du diagnostic et de la surveillance des agents pathogènes et dont le personnel bénéficiera de formations pour utiliser les méthodes de séquençage génomique. De plus, le personnel du secteur de la santé publique est formé pour tracer les chaînes de contamination et le personnel hospitalier apprend à identifier les profils de résistance moléculaire ainsi qu’à développer et à utiliser des stratégies de traitement individualisées et fondées sur les lignes directrices internationales. Cela permet de renforcer l’efficacité des concepts de thérapie et d’améliorer le bien-être des malades en raccourcissant la durée des traitements et en optimisant les résultats des thérapies.

Objectif

Introduction et instauration de technologies de séquençage ultramodernes, comme le séquençage de nouvelle génération (SNG), pour diagnostiquer et surveiller les agents pathogènes résistants ou multirésistants de maladies pulmonaires (notamment tuberculose et SARS CoV 2).

En coopération avec

• Ospedale San Raffaele (OSR), Italie
• Inselspital Bern (ISB), Suisse
• Ministry of Health (MoH Eswatini), Eswatini
• National TB Reference Laboratory (NTRL Eswatini), Eswatini
• COVID-19 National Laboratory (COVIDLab Eswatini), Eswatini
• National TB Control Programme (NTCP Eswatini) Eswatini
• Baylor College of Medicine (BCM Eswatini), Eswatini
• Baylor College of Medicine Houston (BCM Houston), USA
• Instituto Nacional de Saúde (INS)
• Mosambik University of Namibia School of Medicine (UNAM), Namibie