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Surveillance génomique des fièvres hémorragiques virales et d’autres maladies infectieuses d’origine virale susceptibles de provoquer des flambées épidémiques en Afrique subsaharienne

Quatre membres du personnel de séquençage au laboratoire de l'ISTH au Nigeria avec un formateur du BNITM lors d'une formation d'introduction à l'analyse phylogénétique au CRV-LFHVG, Conakry, Guinée (source : BNITM)

Contexte

La pandémie de COVID 19 et diverses autres épidémies de maladies infectieuses d’origine virale des dernières années ont montré à quel point il était indispensable que les laboratoires soient bien préparés et disposent de capacités suffisantes pour pouvoir réagir efficacement aux urgences de santé publique au niveau national. Pour cette raison, l’Assemblée mondiale de la santé a déclaré que la surveillance génomique était une priorité, car cette technologie constitue l’unique possibilité d’identifier, de tracer, de surveiller et de caractériser rapidement les agents pathogènes viraux, ce qui améliore la prise de décision dans le domaine de la santé publique. Pendant la pandémie de COVID 19, des mesures ont déjà été prises pour développer les capacités de séquençage en Afrique subsaharienne. Mais ces capacités doivent absolument être étendues à un large spectre d’autres agents pathogènes viraux pour que ces pays puissent se préparer suffisamment à affronter les menaces causées par les maladies infectieuses. Le projet s’appuie sur la coopération avec des partenaires de longue date et a pour objectif d’améliorer les capacités de surveillance génomique des fièvres hémorragiques virales (FHV) et d’autres maladies infectieuses virales susceptibles de provoquer des flambées épidémiques. Le projet se concentre sur le Nigéria et la Guinée et coopère étroitement avec le personnel des laboratoires locaux. Dans ce contexte, il n’importe pas seulement de renforcer les capacités des laboratoires nationaux de surveillance, mais aussi de proposer des solutions mondiales permettant à ces pays de se préparer aux futures flambées épidémiques et d’y réagir rapidement.

Objectif

Création de capacités de séquençage d’agents pathogènes viraux potentiellement mortels, là où cela s’avère indispensable pour améliorer l’identification des agents pathogènes ainsi que la prévention et la maîtrise des flambées épidémiques.

En coopération avec

  • Irrua Specialist Teaching Hospital (ISTH), Nigéria
  • Centre de Recherches en Virologie – Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales de Guinée (LFHVG), Guinée
  • Université Gamal Abdel Nasser (UGANC), Guinée
  • Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales de Gueckédou (LFHV Gueckédou), Guinée
  • Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales, N’Zérékoré regional hospital (HRNZE), Guinée
  • Evolutionary and Computational Virology, Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Belgium
  • Ministries of health (Nigéria and Guinée)
  • World Health Organization (WHO), Suisse
  • Global Outbreak Alert and Response Network (GOARN)

Priorités thématiques

  • Diagnostic en laboratoire
  • Gestion des flambées épidémiques
  • Renforcement des systèmes de santé publique
  • Surveillance et rapports
  • Une seule santé (One Health)

Faits

Durée

01.01.2023 - 31.12.2025

Budget

env. 2,300,000 euros

Pays partenaires

  • Guinée
  • Nigéria

Contact

Sophie Duraffour
Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin (BNITM)
Bernhard-Nocht-Straße 74, 20359 Hamburg, Allemagne
Courriel : duraffour@bnitm.de

Activités

  • Formation et développement des compétences

    Formation du personnel des laboratoires dans les domaines suivants : réalisation de diagnostics, séquençage de nouvelle génération, analyse bioinformatique, épidémiologie moléculaire et recherche.

  • Achats de matériels et équipements et développement des

    Mise en place de laboratoires stationnaires et mobiles pour la surveillance génomique

  • Renforcement des capacités

    Développement des capacités de séquençage dans trois laboratoires ; appui à la mise en œuvre du traitement bioinformatique des données de séquençage et à leur analyse (matériel et logiciel) ; introduction de systèmes de gestion de la qualité pour garantir la fourniture de données de séquençage génomique de haute qualité

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